Porcentaje de GC
Mediante la herramienta DNA Stats explicada en el procedimiento, se puede obtener información valiosa sobre la composición de bases del contig. En el caso del Contig 5 el resultado es el siguiente:
Nucleotido | Número de veces encontrado | Porcentaje |
G | 1669 | 19,21 |
A | 2512 | 28,91 |
T | 2704 | 31,12 |
C | 1805 | 20,77 |
G,C | 3474 | 39,98 |
A,T | 5216 | 60,02 |
Tabla 5.1 - Contenido de G, A , T, C, GC y AT del contig5
Conociendo, como se viene explicando en el resto de contigs, que son los exones los que presentan, generalmente, un porcentaje de GC superior y son los intrones los que presentan un porcentaje de AT superior se estudia en este caso si dicha premisa se cumple para lo cual, se realiza el mismo procedimiento que para el contig en su totalidad pero únicamente con el exón del SRY (Forward). No se adjunta el resultado para el SRY (Reverse) porque la diferencia es insignificante:
Nucleotido | Número de veces encontrado | Porcentaje |
G | 153 | 24,88 |
A | 187 | 30,41 |
T | 119 | 19,35 |
C | 156 | 25,37 |
G,C | 309 | 50,24 |
A,T | 306 | 49,56 |
Tabla 5.2 - Contenido de G, A , T, C, GC y AT del exón SRY (Forward)
En este caso parece que los resultados se confirman. El porcentajde GC aumenta considerablemente respecto al contig en completo y el porcentaje de AT, como es lógico, disminuye.