Porcentaje de GC
El cóntigo 4 tiene 5021 nucleótidos y comienza por GATTTCTTCC. Utilizando la herramienta DNA stats hemos calculado el porcentaje de cada una de las bases: G 25.79%, A 23.64%, T 23.96% y C 26.33%.
| Base | Veces encontrada | Porcentaje |
| G | 802 | 26'72% |
| A | 678 | 25'58% |
| T | 702 | 23'38% |
| C | 820 | 27,32% |
Tabla 4. 1. Porcentaje de G, A, T, C, GC y AT en la secuencia del contig 4.
Además, hemos calculado que el contenido en GC es de 52.12%. Este parámetro es importante ya que en una sección larga de la secuencia genómica, los genes se caracterizan a menudo por un GC más alto comparado con el genoma entero. Particularmente, los exones son genes con GC alto, mientras que los intrones tienen generalmente AT alto (GC bajo). En este caso, el valor GC relativamente alto nos indica que probablemente existan genes transcripcionalmente activos en el cóntigo.
Si a continuacion analizamos con la misma herramienta la secuencia del exon vemos que:
| Base | Veces encontrada | Porcentaje |
| G | 313 | 31'21% |
| A | 164 | 16'35% |
| T | 192 | 19'14% |
| C | 334 | 33'3% |
Tabla 4. 2. Porcentaje de G, A, T, C, GC y AT en la secuencia del exon contenida en el contig 4.
El contenido en GC en el exón es superior, dado que es de un 64'51%.