Primers
Con el objetivo de estudiar mejor las variaciones funcionales provocadas por las mutaciones. Se realizara una PCR de las secuencias de ácidos nucleicos variados. Para ello es necesario el diseño de Primers, empleándose el programa bioinformatico Biotools.
De acuerdo a lo explicado en procedimientos se realizara la PCR de 1000 bases, abarcando entre ellas todos los SNPs. De modo que la secuencia a amplificar es la siguiente:
>Contig4
ATGTGGAGCTGCAGCTGGTTCAACGGCACAGGGCTGGTGGAGGAGCTGCCTGCCTGCCAG
GACCTGCAGCTGGGGCTGTCACTGTTGTCGCTGCTGGGCCTGGTGGTGGGCGTGCCAGTG
GGCCTGTGCTACAACGCCCTGCTGGTGCTGGCCAACCTACACAGCACGGCCAGCATGACC
ATGCCGGACGTGTACTTTGTCAACATGGCAGTGGCAGGCCTGGTGCTCAGCGCCCTGGCC
CCTGTGCACCTGCTCGGCCCCCCGAGCTCCCGGTGGGCGCTGTAGAGTGTGGGCGCCGAA
GTCCACGTGGCACTGCAGATCCCCTTCAATGTGTCCTCACTGGTGGCCATGTACTCCACC
GCCCTGCTGAGCCTCGACCACTACATCGAGCGTGCACTGCCGCGGACCTACATGGCCAGC
GTGTACAACACGCGGCACGTGTGCGGCTTCGTGTGGGGTGGCGCGCTGCTGACCAGCTTC
TCCTCGCTGCTCTTCTACATCTGCAGCCATGTGTCCACCCGCGCGCTAGAGTGCGCCAAG
ATGCAGAACGCAGAAGCTGCCGACGCCACGCTGGTGTTCATCGGCTACGTGGTGCCAGCA
CTGGCAACCCTCTACGCGCTGGTGCTACTCTCCCGCGTCCGCAGGGAGGACACGCCCCTG
GACCGGGACACGGGCCGGCTGGAGCCCTCGGCACACAGGCTGCTGGTGGCCACCGTGTGC
ACGCAGTTTGGGATCTGGACGCCACACTATCTGATCCTGCTGGGGCACACGGTCATCCTC
TCGCGAGGGAAGCCCGTGGACGCACACTACCTGGGGCTACTGCACTTTGTGAAGGATTTC
TCCAAACTCCTGGCCTTCGCCAGCAGCTTTGTGACACCACTTCTCTACCGCTACATGAAC
CAGAGCTTCCCCAGCAAGCTCCAACGGCTGATGAAAAAGCTGCCCTGCGGGGACCGGCAC
TGCTCCCCGGACCACATGGGGGTGCAGCAGGTGCTGGCGT
Los primers creados por el programa son los siguientes:
Figura 4. 9. resultado de los primers generados por el programa Biotools, y como se dispondrian en la secuencia de bases.