Búsqueda de ORF
En el siguiente paso realizaremos la búsqueda de genes dentro de nuestro contig, para ello se empleara el programa ORF finder. Este programa presenta los posibles ORF a partir de las 6 pautas de lecturas posibles. En total el programa encuentra 20 ORF.
Figura 4. 2. Resultado obtenido del ORF finder, donde aparecen las 6 pautas posibles de lectura. Morado se ve el gen identificado por el BLAST, mientras que en azul los posibles ORFs.
Empleando BLAST, podemos determinar cuál de estos ORF coincide con la secuencia de algún gen. En este caso el ORF2, coincide con una identidad del 99% con el gen GPR146 de la especie Homo sapiens.