Transposones
Para localizar las secuencias repetitivas y los transposones se ha empleado el programa Censor, la informacion los resultados obtenidos se presentan de la siguiente manera:
Figura 1. 3. Resultado de la busqueda de transposones realizada por el programa Censor.
De todos los posibles transposones que encontrasmos el unico que cumple con los criterios, es el fragmento marinern12_AG, el cual tiene un tamaño de 500 bases, una similitud del 80% y un score alto de 2134. Este fragmento abarca desde la base 3870 a la 4326. De modo que las bases correspondientes seran sustituidas por N, para que asi al realizar futuros alineamientos no sean tenidas en cuenta.
Buscando informacion sobre este transposon, descubrimos que es un nonautonomus DNA transposon de la malaria de los mosquitos africanos