Porcentaje de GC
El cóntigo 1 tiene 4711 nucleótidos y comienza por TATTTTCAAT. Utilizando la herramienta DNA stats hemos calculado el porcentaje de cada una de las bases: G 24.52%, A 25.03%, T 24.69% y C 25.34%. Además, hemos calculado que el contenido en GC es de 49,86%.
| Base | Veces encotrada | Porcentaje |
| G | 1155 | 24’52% |
| A | 1179 | 25’03% |
| T | 1163 | 24’69% |
| C | 1194 | 25’34% |
Tabla 1.1. Porcentaje de G, A, T, C, GC y AT en la secuencia del contig 1.
Este parámetro es importante ya que en una sección larga de la secuencia genómica, los genes se caracterizan a menudo por un GC más alto comparado con el genoma entero. Particularmente, los exones son genes con GC alto, mientras que los intrones tienen generalmente AT alto (GC bajo). En este caso, el valor GC no es relativamente muy alto.
Pero si analizamos el porcentaje de GC en solamente en las secuencias de los exones, encontramos que:
| Base | Veces encotrada | Porcentaje |
| G | 1155 | 30.93% |
| A | 1179 | 20'68% |
| T | 1163 | 19'2% |
| C | 1194 | 29,2% |
Tabla 1. 2. Porcentaje de G, A, T, C, GC y AT en la secuencia del exón encontrado en el contig 1.
El porcentaje de GC en el exon es del 60'12, luego el contenido en GC se concentra en los exones.