Ortólogos

Para conocer el grado de conservación de nuestra proteína, se realizan alineamientos con dos ortólogos, para ello se comparan el  DNA genómico y la secuencia de la proteína de Drosophila melanogaster y de Dendroctonus ponderosae.

• Al comparar el DNA genómico presente en nuestro contig con ambas especies los resultados que obtenemos son:

Tabla 1.4. Resultados de los alienamientos realzados de la secuencia de DNA genomico presente en el contig 1, frente la secuencia de DNA genomico de los ortologos. 

Drosophila melanogaster 

Dendroctonus ponderosae

• En el caso de las proteínas:

Tabla 1.5. Resultados de los alienamientos realzados de la secuencia de la proteina sintetizada a partir del DNA presente en el contig 1, frente la secuencia de aminoácidos de las proteínas de los ortologos. 

Entre los gaps se encuentran las secuencias de la proteína conservadas en ambas especies, se puede ver que esas secuencias en común coinciden en ambas especies. De modo que podemos suponer que pertenecen al centro activo de proteína, y por lo tanto son los dominios que le dan funcionalidad a la proteína.