Ortólogos

Las secuencias o genes ortólogos son aquellas secuencias homólogas que se han separado por un evento de especiación. Es decir, cuando una especie diverge en dos especies separadas, las copias divergentes de un mismo gen en las especies resultantes se dice que son ortólogas. En otras palabras, las secuencias ortólogas son las secuencias que se encuentran en diferentes especies y que son altamente similares debido a que se han originado en un ancestro común.

Se han elegido dos especies con las cuales comparar nuestra secuengia del gen que han sido Vervet-AGM (Chlorocebus sabaeus) y Cow (Bos taurus).

Comenzaremos con un primer blast de la secuencia de la parte del gen HBB loacalizada en el contig 2 frente a la secuencia del gen HBB de Vervet, recogida en un pdf adjunto.

secuencia gen HBB VERVET.pdf (109851)

Una vez realizado esto se ha llevado a cabo un nuevo blast, esta vez de la secuencia completa del gen HBB frente a Vervet de nuevo.

Se ha llevado a cabo el mismo trabajo para la otra especie Cow (Bos taurus) cuya secuencia se adjunta a continuación. Los resultados obtenidos se han recogido en la tabla 2.3.

secuencia gen HBB COW.pdf (157647)

Tabla 2.3. Recoge las distintas variables que se han observado para llevar a cabo la comparación con los ortólogos. En la primera fila (dividida en tres columnas) en cada una de las columnas se recoge qué se ha comparado frente a la secuencia del gen HBB tanto de Vervet como de Cow; en la segunda fila se recogen las dos variables medidas: query covery e identidad.